Las metas que proponemos para este semestre son las siguientes:
(1). Instalar y poner a correr el programa “Auto Dock” utilizando las facilidades del “High Performance Computer Facility” de la UPR de Rio Piedras.
(3). Este proceso de “docking” sera repetido con otros péptidos similares que hemos identificado en otros viruses que utilizan ese mismo receptor.
En el semestre anterior identificamos por medio de bioinformatica una serie de motifs en la proteina de la cubierta de viruses de la Familia Flaviviridae a la que pertenece el virus del Dengue. Nuestra hypotesis en este momento es que este segmento pequeño de estas proteinas le permite interactuar con su receptor (“protein-protein interacction motif”). Durante este semestre se continuara este trabajo mediante un analisis de la interaccion potencial entre este segmento de la proteina o peptido con uno de sus receptores. Esto se llevara a cabo mediante el uso del programa de computadora “Autodock”.
Las nueva técnica que pienso desarrollar es principalmete; aprender a utilizar el programa Auto Dock, el cual es uno sumamente complicado
